Das Krankenhaus Pfaffenhofen, Teil der Ilmtalklinik GmbH, verfügt über 220 Betten und bietet eine Grund- und Regelversorgung in den Bereichen Innere Medizin (Gastroenterologie, Kardiologie), Allgemein- und Viszeralchirurgie, Orthopädie und Unfallchirurgie, Gynäkologie und Geburtshilfe sowie Anästhesie und Intensivmedizin. Darüber hinaus ist der Standort Pfaffenhofen spezialisiert auf Akutgeriatrie, Neurologie und Schlaganfallmedizin. Der Standort in Mainburg verfügt zudem über ein zertifiziertes Endoprothetikzentrum.
Die Ilmtalklinik GmbH besteht aus zwei Kliniken an den Standorten Pfaffenhofen und Mainburg. Beide Kliniken, mit insgesamt rund 320 Betten, gehören zur Grund- und Regelversorgung und befinden sich in einer der schönsten Regionen Bayerns. Rund 720 Mitarbeiter setzen sich täglich dafür ein, die bestmögliche Versorgung für die Patienten sicherzustellen. Als Mitglied der Klinik-Kompetenz Bayern eG gewährleistet die Klinik eine Patientenversorgung auf höchstem Niveau. Beide Standorte sind qualitätszertifiziert nach ISO 9001:2015.
Als Mitgesellschafter der Klinikallianz Mittelbayern GmbH engagiert sich die Klinik für den Erhalt der Kliniken in kommunaler Trägerschaft.