Die Klinik für Allgemein- und Viszeralchirurgie/Proktologie (Stellenplan derzeit 1/3/5) verfügt über ca. 30 Betten inklusive eines bedarfsorientierten Kontingents auf der interdisziplinären ITS sowie Kinderstation. Die Klinik versorgt jährlich ca. 1.300 stationäre Patienten. Bevorzugt kommen minimal-invasive Techniken zum Einsatz. Schwerpunktmäßig wird die colorektale und endokrine Chirurgie betrieben, aber auch kinderchirurgische und thoraxchirurgische Eingriffe werden durchgeführt. Alle diagnostischen Verfahren stehen zur Verfügung. Es besteht eine enge Kooperation mit der gastroenterologischen Abteilung sowie mit der angegliederten onkologischen und strahlentherapeutischen Praxis. Zusätzlich besteht die volle Weiterbildungsermächtigung für die Viszeralchirurgie und partiell für die Spezielle Viszeralchirurgie. Als „Schilddrüsenzentrum Ostfrieslands“ ist die Abteilung Mitglied des Deutschen Schilddrüsenzentrums. Die Klinik für Allgemein- und Viszeralchirurgie/Proktologie ist darüber hinaus ein zertifiziertes Hernienzentrum und ein Teil von Herniamed (DHG).
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